港大在張翔出任校長後，2年內7位副校長級教職員已有4位辭職，並據香港01獲悉，北京清華大學工業工程繫系主任申作軍，及北京清大地球系統科學系主任宮鵬2人將同時出任副校長，分別主管研究和學術發展。
根據北京清大工業工程系官網的「黨政機構」資料顯示，其中申作軍除了是工業工程系的系主任外，同時還身兼該學系「系黨委」的黨委委員，即是中共黨員。但消息曝光後，申作軍從「系黨委」名單中被移除，現時網頁僅顯示他是系主任。
此外，申作軍還被髮現過去曾參與「千人計劃」的海外高層次人才引進計劃，而該計劃在2018年遭美國聯邦調查局（FBI）調查，並有不少中國學者被以間諜罪逮捕。
而另一名中國學者宮鵬，則曾被內地知名網絡作家「方舟子」質疑誇大個人履歷，與現任港大校長張翔是學長學弟關係，同於南京大學獲學士及碩士學位。並且，張翔、宮鵬和申作軍都曾任教於柏克萊加州大學（UC Berkeley），因此，有聲音質疑3人關係匪淺。
另據蘋果日報報導，張翔自2018年上任後，外界一直盛傳張與港大原有管治團隊不和，質疑張翔一直想籌組「自己人」團隊。更據消息指，申作軍和宮鵬分別獲相關物色委員會推薦，而推薦兩人的物色委員會主席均爲張翔。
對此，前香港衆志副主席鄭家郎表示，因2人分別掌管研究經費分配和學術人員的招聘續約升遷等事宜，可以輕易的以研究經費及職位控制學術研究方向甚至結果，擔憂港大染紅的未來只怕不遠。尤其，申作軍作爲中共黨員，必定緊跟中共路線，不會允許與中國相關的負面研究，甚至可能以研究經費施壓學者不能批評中共。若港大校委會通過該2名副校長的任命，到時港大恐將進一步失去學術自主，百年名聲將一朝喪盡。
黃之鋒也於臉書表示，如果任命真的成事，將會首次有中共黨員執掌香港大學，指出「黨國系統逐漸控制香港學術機關，學術自由將蕩然無存。」
港大校委會將於本月27日進行會議，若通過任命，2人最快明年1月履新，任期5年。
